Trabzon Havalimanı'nda 13 Ocak akşamı iniş sırasında pistten çıkan Pegasus Havayolları'na ait yolcu uçağı bulunduğu yerden vinç yardımı ile çıkartılmasının ardından kurtarma operasyonundaki son aşama olan güvenli bölgeye çekilme işlemi de başladı.
Pistten çıkan uçak için saat 04:00 sıralarında başlayan kurtarma çalışmaları kapsamında 500 ve 350 tonluk 2 vinç kurulurken, saatler süren emeğin ardından uçak bulunduğu yerden çıkartılarak pist üzerine getirildi. Kuyruk, kanat ve burun kısmından halatlarla vince bağlanan uçak yerden metrelerce yukarıda tutulurken, itfaiye araçlarının sıktığı su ile alt bölümü de tamamen çamurdan temizlendi. Bulunduğu yerden alınan uçak pist kenarındaki toprak zemine indirilirken, uçağın kazadan ötürü zarar gören motorun bulunduğu sağ kanadına "Dolly" (Küçük tekerlekli taşıma aracı) yerleştirilirken, kaza sırasında zarar gören ön ve sol arka lastikleri burada değiştirildi. Uçak bu işlemlerin ardından çekici yardımı ile yürütülerek güvenli bölgeye çekilmeye başlandı.